Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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