Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NAE1Q13564 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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