Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PKD2Q13563 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
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