Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NEUROD1Q13562 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEUROD1Q13562 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
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