Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN4PQ13434 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
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