Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSLNQ13421 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSLNQ13421 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSLNQ13421 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSLNQ13421 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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