Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SP140Q13342 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SP140Q13342 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SP140Q13342 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SP140Q13342 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SP140Q13342 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SP140Q13342 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SP140Q13342 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SP140Q13342 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SP140Q13342 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SP140Q13342 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SP140Q13342 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SP140Q13342 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SP140Q13342 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SP140Q13342 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SP140Q13342 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SP140Q13342 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SP140Q13342 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SP140Q13342 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SP140Q13342 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SP140Q13342 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SP140Q13342 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SP140Q13342 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SP140Q13342 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SP140Q13342 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SP140Q13342 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SP140Q13342 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SP140Q13342 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SP140Q13342 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SP140Q13342 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SP140Q13342 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SP140Q13342 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SP140Q13342 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SP140Q13342 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SP140Q13342 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SP140Q13342 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SP140Q13342 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SP140Q13342 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SP140Q13342 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SP140Q13342 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SP140Q13342 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SP140Q13342 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SP140Q13342 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SP140Q13342 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SP140Q13342 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SP140Q13342 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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SP140Q13342 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
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SP140Q13342 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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SP140Q13342 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SP140Q13342 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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SP140Q13342 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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SP140Q13342 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SP140Q13342 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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SP140Q13342 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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SP140Q13342 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SP140Q13342 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SP140Q13342 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SP140Q13342 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SP140Q13342 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SP140Q13342 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SP140Q13342 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SP140Q13342 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SP140Q13342 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SP140Q13342 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SP140Q13342 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SP140Q13342 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SP140Q13342 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SP140Q13342 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SP140Q13342 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SP140Q13342 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SP140Q13342 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SP140Q13342 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SP140Q13342 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SP140Q13342 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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