Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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SGCGQ13326 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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SGCGQ13326 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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SGCGQ13326 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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SGCGQ13326 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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SGCGQ13326 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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SGCGQ13326 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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SGCGQ13326 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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SGCGQ13326 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
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SGCGQ13326 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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SGCGQ13326 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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SGCGQ13326 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
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SGCGQ13326 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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SGCGQ13326 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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SGCGQ13326 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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