Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
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