Protein–RNA interactions for Protein: Q13103

SPP2, Secreted phosphoprotein 24, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP2Q13103 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms