Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC16Q13042 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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