Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIK2Q13002 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK2Q13002 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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