Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNIP3Q12983 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms