Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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