Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 SSF1YHR066W 1362 nt2.37□□□□□ -2.03
TY2B-BQ12491 SPR28YDR218C 1272 nt2.37□□□□□ -2.03
TY2B-BQ12491 AIM23YJL131C 1071 nt2.37□□□□□ -2.03
TY2B-BQ12491 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt2.37□□□□□ -2.03
TY2B-BQ12491 YOR146WYOR146W 306 nt2.37□□□□□ -2.03
TY2B-BQ12491 GEA2YEL022W 4380 nt2.37□□□□□ -2.03
TY2B-BQ12491 LCB4YOR171C 1875 nt2.37□□□□□ -2.03
TY2B-BQ12491 CDC60YPL160W 3273 nt2.37□□□□□ -2.03
TY2B-BQ12491 ISW1YBR245C 3390 nt2.36□□□□□ -2.03
TY2B-BQ12491 HMO1YDR174W 741 nt2.36□□□□□ -2.03
TY2B-BQ12491 SPS18YNL204C 903 nt2.36□□□□□ -2.03
TY2B-BQ12491 RPS30BYOR182C 192 nt2.36□□□□□ -2.03
TY2B-BQ12491 MEC1YBR136W 7107 nt2.36□□□□□ -2.03
TY2B-BQ12491 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.36□□□□□ -2.03
TY2B-BQ12491 RRI1YDL216C 1323 nt2.36□□□□□ -2.03
TY2B-BQ12491 YJU2YKL095W 837 nt2.36□□□□□ -2.03
TY2B-BQ12491 PHS1YJL097W 654 nt2.35□□□□□ -2.03
TY2B-BQ12491 RPS1AYLR441C 768 nt2.35□□□□□ -2.03
TY2B-BQ12491 DNF3YMR162C 4971 nt2.35□□□□□ -2.03
TY2B-BQ12491 TOR2YKL203C 7425 nt2.34□□□□□ -2.03
TY2B-BQ12491 YLR419WYLR419W 4308 nt2.34□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 NOP14YDL148C 2433 nt2.34□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 TRA1YHR099W 11235 nt2.34□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 GPP2YER062C 753 nt2.33□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 YJR111CYJR111C 852 nt2.33□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 ATP11YNL315C 957 nt2.33□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 snR37snR37 386 nt2.33□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 COG4YPR105C 2586 nt2.33□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 HSL1YKL101W 4557 nt2.33□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 YGR293CYGR293C 462 nt2.33□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.33□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 YOL057WYOL057W 2136 nt2.32□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 SRG1SRG1 551 nt2.32□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 SMX2YFL017W-A 234 nt2.32□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 SWC4YGR002C 1431 nt2.32□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 COQ9YLR201C 783 nt2.32□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 SEC65YML105C 822 nt2.32□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 HUA2YOR284W 732 nt2.32□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 TMA64YDR117C 1698 nt2.32□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 VBA4YDR119W 2307 nt2.32□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 MDM10YAL010C 1482 nt2.32□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 PDR8YLR266C 2106 nt2.31□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 YNL144CYNL144C 2223 nt2.31□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 OKP1YGR179C 1221 nt2.31□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 YJR056CYJR056C 711 nt2.31□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 HMT1YBR034C 1047 nt2.31□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 YPR027CYPR027C 834 nt2.31□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 RIM13YMR154C 2184 nt2.31□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 CWC22YGR278W 1734 nt2.3□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 TRZ1YKR079C 2517 nt2.3□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 TRX1YLR043C 312 nt2.3□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 YLR462WYLR462W 609 nt2.3□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 SOK2YMR016C 2358 nt2.3□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 UTP21YLR409C 2820 nt2.3□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 YML094C-AYML094C-A 402 nt2.29□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 ATG34YOL083W 1239 nt2.29□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 SIR3YLR442C 2937 nt2.29□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 PHO12YHR215W 1404 nt2.29□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 PHO11YAR071W 1404 nt2.29□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 GNT1YOR320C 1476 nt2.28□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 PAU2YEL049W 363 nt2.28□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 PAU12YGR294W 363 nt2.28□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 PAU18YLL064C 363 nt2.28□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 REC102YLR329W 795 nt2.28□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 PAU6YNR076W 363 nt2.28□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 PAU24YBR301W 363 nt2.28□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 MAK10YEL053C 2202 nt2.28□□□□□ -2.04
TY2B-BQ12491 CTF13YMR094W 1437 nt2.28□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 NAN1YPL126W 2691 nt2.27□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 RRP7YCL031C 894 nt2.26□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 BNI1YNL271C 5862 nt2.26□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YHR095WYHR095W 495 nt2.26□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 NNT1YLR285W 786 nt2.26□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 HHF2YNL030W 312 nt2.26□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 IBD2YNL164C 1056 nt2.26□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 SWD3YBR175W 948 nt2.26□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 PRP6YBR055C 2700 nt2.26□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 SMI1YGR229C 1518 nt2.25□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.25□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.25□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.25□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.25□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YER138CYER138C 5268 nt2.25□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YER160CYER160C 5268 nt2.25□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.25□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.25□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YJR027WYJR027W 5268 nt2.25□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.25□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YML039WYML039W 5268 nt2.25□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YML045WYML045W 5268 nt2.25□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YMR050CYMR050C 5268 nt2.25□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.25□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.25□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.25□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.25□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.25□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 FIN1YDR130C 876 nt2.25□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YDR401WYDR401W 564 nt2.25□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YML053CYML053C 639 nt2.25□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt2.25□□□□□ -2.05
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