Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 snR32snR32 188 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 TYW1YPL207W 2433 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 GWT1YJL091C 1473 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 SLK19YOR195W 2466 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 MCX1YBR227C 1563 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 SHS1YDL225W 1656 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 YND1YER005W 1893 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 ECM32YER176W 3366 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 ARP2YDL029W 1176 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 MLC1YGL106W 450 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 VAM7YGL212W 951 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 YIL171WYIL171W 330 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 YKE2YLR200W 345 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 RDN58-1RDN58-1 158 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 RDN58-2RDN58-2 158 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 YOR200WYOR200W 399 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 UBP10YNL186W 2379 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 DAL81YIR023W 2913 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 ACC1YNR016C 6702 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 VBA2YBR293W 1425 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 OTU1YFL044C 906 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 JIP3YLR331C 378 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 DGK1YOR311C 873 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 TSC3YBR058C-A 243 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 DIB1YPR082C 432 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-DR3Q12441 TPS3YMR261C 3165 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 ACK1YDL203C 1872 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 YRF1-4YLR466W 4149 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 RPP1AYDL081C 321 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 AAD4YDL243C 990 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 IRC2YDR112W 309 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 MFA1YDR461W 111 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 SYO1YDL063C 1863 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 SKN7YHR206W 1869 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 NOC2YOR206W 2133 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 SYG1YIL047C 2709 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 YFL015CYFL015C 495 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 HIS5YIL116W 1158 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 YIR014WYIR014W 729 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 HYR1YIR037W 492 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 PAM18YLR008C 507 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 TEN1YLR010C 483 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 INN1YNL152W 1230 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 MRPS16YPL013C 366 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 APE3YBR286W 1614 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 RRN11YML043C 1524 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 BUD6YLR319C 2367 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 BRF1YGR246C 1791 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 YHL026CYHL026C 948 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 REI1YBR267W 1182 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 YCL023CYCL023C 348 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 TDA7YNL176C 1911 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 RAD53YPL153C 2466 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 GSY1YFR015C 2127 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 VAC8YEL013W 1737 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 UTP4YDR324C 2331 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 KCC4YCL024W 3114 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 YDR133CYDR133C 336 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 SUP19tS(UGA)E 82 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 SUP17tS(UGA)I 82 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 SUP16tS(UGA)P 82 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 UBC7YMR022W 498 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 YOL114CYOL114C 609 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 snR51snR51 107 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 HDA2YDR295C 2025 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 GSM1YJL103C 1857 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 PDI1YCL043C 1569 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 snR68snR68 136 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 OPI6YDL096C 327 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 AHA1YDR214W 1053 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 RRP45YDR280W 918 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 SUR2YDR297W 1050 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 ATP5YDR298C 639 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 GPP2YER062C 753 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 YGL165CYGL165C 579 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 CSR1YLR380W 1227 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 PRE5YMR314W 705 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 YBL108WYBL108W 306 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 YBR016WYBR016W 387 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 SCY1YGL083W 2415 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 VPS45YGL095C 1734 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 AIM14YGL160W 1713 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 YTA6YPL074W 2265 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 NOT5YPR072W 1683 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 GRX4YER174C 735 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 RPB9YGL070C 369 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 YOR146WYOR146W 306 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 RRD2YPL152W 1077 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 PHO87YCR037C 2772 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 IRC10YOL015W 1761 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-DR3Q12441 ADE3YGR204W 2841 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 TAF12YDR145W 1620 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 JAC1YGL018C 555 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 EPT1YHR123W 1176 nt4.77□□□□□ -1.65
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