Protein–RNA interactions for Protein: Q12398

HMS1, Probable transcription factor HMS1, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMS1Q12398 SEC4YFL005W 648 nt2.78□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 CDC26YFR036W 375 nt2.78□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 COG7YGL005C 840 nt2.78□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.78□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 COX23YHR116W 456 nt2.78□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.78□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 RSM19YNR037C 276 nt2.78□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 PEX27YOR193W 1131 nt2.78□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 RFC5YBR087W 1065 nt2.78□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 CMD1YBR109C 444 nt2.78□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 YPS6YIR039C 1614 nt2.78□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 YTA7YGR270W 4140 nt2.78□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 ENP2YGR145W 2124 nt2.77□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 JSN1YJR091C 3276 nt2.77□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 TRM82YDR165W 1335 nt2.77□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 SMT3YDR510W 306 nt2.77□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 PAU10YDR542W 363 nt2.77□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 PAU11YGL261C 363 nt2.77□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 MRPL9YGR220C 810 nt2.77□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 DOG2YHR043C 741 nt2.77□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 YJL175WYJL175W 513 nt2.77□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 RPS30AYLR287C-A 192 nt2.77□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 PAU4YLR461W 363 nt2.77□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 BET5YML077W 480 nt2.77□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 HHF2YNL030W 312 nt2.77□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 YBR090CYBR090C 369 nt2.77□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 SAG1YJR004C 1953 nt2.77□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 FUN30YAL019W 3396 nt2.77□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 APC5YOR249C 2058 nt2.77□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 FLO11YIR019C 4104 nt2.76□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt2.76□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 VAB2YEL005C 849 nt2.76□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 YGR073CYGR073C 372 nt2.76□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 THP2YHR167W 786 nt2.76□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 CTK2YJL006C 972 nt2.76□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 SEC14YMR079W 915 nt2.76□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 RUF5-1RUF5-1 710 nt2.76□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 RUF5-2RUF5-2 710 nt2.76□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 PEX11YOL147C 711 nt2.76□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 HHF1YBR009C 312 nt2.76□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 YPR027CYPR027C 834 nt2.76□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 DPB3YBR278W 606 nt2.76□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 CIN1YOR349W 3045 nt2.76□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 KIN82YCR091W 2163 nt2.76□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 MET10YFR030W 3108 nt2.75□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 DUF1YOL087C 3351 nt2.75□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 ESA1YOR244W 1338 nt2.75□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.75□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 YKL115CYKL115C 393 nt2.75□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 RPL20BYOR312C 519 nt2.75□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 ADY4YLR227C 1482 nt2.75□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 SKT5YBL061C 2091 nt2.75□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 SAP1YER047C 2694 nt2.75□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 PEX6YNL329C 3093 nt2.74□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 RPL13AYDL082W 600 nt2.74□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 YFL012WYFL012W 447 nt2.74□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 SMX2YFL017W-A 234 nt2.74□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 BTN2YGR142W 1233 nt2.74□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.74□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt2.74□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 YLR416CYLR416C 399 nt2.74□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt2.74□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 PRP8YHR165C 7242 nt2.74□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 NTO1YPR031W 2247 nt2.73□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 VPS17YOR132W 1656 nt2.73□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 ESL1YIL151C 3357 nt2.73□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 PIG2YIL045W 1617 nt2.73□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 ATC1YDR184C 885 nt2.73□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 GOS1YHL031C 672 nt2.73□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 RPL27AYHR010W 411 nt2.73□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.73□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 YLL037WYLL037W 381 nt2.73□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 RNH203YLR154C 333 nt2.73□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 YAR069CYAR069C 294 nt2.73□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 FAR3YMR052W 615 nt2.73□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 MRPL16YBL038W 699 nt2.73□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 YNL050CYNL050C 813 nt2.73□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 MER1YNL210W 813 nt2.73□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 MGE1YOR232W 687 nt2.73□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 YPR053CYPR053C 456 nt2.73□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 ARP5YNL059C 2268 nt2.73□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 GPM2YDL021W 936 nt2.72□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 YPD1YDL235C 504 nt2.72□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 NRG1YDR043C 696 nt2.72□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 YDR209CYDR209C 414 nt2.72□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 YEL075CYEL075C 369 nt2.72□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 STE2YFL026W 1296 nt2.72□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 PNC1YGL037C 651 nt2.72□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 CDC55YGL190C 1581 nt2.72□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 MIG2YGL209W 1149 nt2.72□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt2.72□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 AIM25YJR100C 984 nt2.72□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 GPX1YKL026C 504 nt2.72□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 RPC25YKL144C 639 nt2.72□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 RPC37YKR025W 849 nt2.72□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 YLR050CYLR050C 486 nt2.72□□□□□ -1.97
HMS1Q12398 NDL1YLR254C 570 nt2.72□□□□□ -1.97
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