Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 CPA2YJR109C 3357 nt2.44□□□□□ -2.02
TY1B-GR3Q12316 LDB17YDL146W 1476 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1B-GR3Q12316 CBS2YDR197W 1170 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1B-GR3Q12316 SWD3YBR175W 948 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1B-GR3Q12316 RRI1YDL216C 1323 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1B-GR3Q12316 LAP3YNL239W 1365 nt2.42□□□□□ -2.02
TY1B-GR3Q12316 PFD1YJL179W 330 nt2.42□□□□□ -2.02
TY1B-GR3Q12316 YJU2YKL095W 837 nt2.42□□□□□ -2.02
TY1B-GR3Q12316 AFT2YPL202C 1251 nt2.42□□□□□ -2.02
TY1B-GR3Q12316 FES1YBR101C 873 nt2.42□□□□□ -2.02
TY1B-GR3Q12316 GEA2YEL022W 4380 nt2.42□□□□□ -2.02
TY1B-GR3Q12316 IRA1YBR140C 9279 nt2.42□□□□□ -2.02
TY1B-GR3Q12316 SSF1YHR066W 1362 nt2.42□□□□□ -2.02
TY1B-GR3Q12316 PEX11YOL147C 711 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1B-GR3Q12316 ACM1YPL267W 630 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1B-GR3Q12316 SAD1YFR005C 1347 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1B-GR3Q12316 PDR8YLR266C 2106 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1B-GR3Q12316 DNF3YMR162C 4971 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1B-GR3Q12316 CPR5YDR304C 678 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1B-GR3Q12316 MPP6YNR024W 561 nt2.4□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 MEC1YBR136W 7107 nt2.4□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 YPK1YKL126W 2043 nt2.4□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.39□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 SRG1SRG1 551 nt2.39□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 TRZ1YKR079C 2517 nt2.39□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 LCB4YOR171C 1875 nt2.39□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 HMO1YDR174W 741 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 YHR095WYHR095W 495 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 RSM25YIL093C 795 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 DAD2YKR083C 402 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 SPO20YMR017W 1194 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 ROM2YLR371W 4071 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 TOR2YKL203C 7425 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 PHR1YOR386W 1698 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 SMI1YGR229C 1518 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 ENV10YLR065C 546 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 DSE3YOR264W 1293 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 POC4YPL144W 447 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 FAR11YNL127W 2862 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 OKP1YGR179C 1221 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 AIM23YJL131C 1071 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 YOR146WYOR146W 306 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 YLR419WYLR419W 4308 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 NAN1YPL126W 2691 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 MDM10YAL010C 1482 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 PHO12YHR215W 1404 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 PHO11YAR071W 1404 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 DAD3YBR233W-A 285 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 CFT2YLR115W 2580 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 UTP21YLR409C 2820 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 CTF13YMR094W 1437 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 RPS1AYLR441C 768 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 CPR8YNR028W 927 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 YBR090CYBR090C 369 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 HDA2YDR295C 2025 nt2.34□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 SLX9YGR081C 633 nt2.34□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 DID4YKL002W 699 nt2.34□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 TRX1YLR043C 312 nt2.34□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 COQ9YLR201C 783 nt2.34□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 RRP7YCL031C 894 nt2.34□□□□□ -2.03
TY1B-GR3Q12316 ISW1YBR245C 3390 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 SEC65YML105C 822 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 HUA2YOR284W 732 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 PGS1YCL004W 1566 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 DSN1YIR010W 1731 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 YGL176CYGL176C 1665 nt2.32□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 YFR045WYFR045W 930 nt2.32□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 ATG34YOL083W 1239 nt2.32□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 YPR027CYPR027C 834 nt2.32□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 IRE1YHR079C 3348 nt2.32□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 PRP6YBR055C 2700 nt2.32□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 RNY1YPL123C 1305 nt2.32□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 MAK10YEL053C 2202 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 LSM1YJL124C 519 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 CLU1YMR012W 3834 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 TOP1YOL006C 2310 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 GSH2YOL049W 1476 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 CWC22YGR278W 1734 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 MED2YDL005C 1296 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 SWC4YGR002C 1431 nt2.3□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 ATP11YNL315C 957 nt2.3□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 VPS35YJL154C 2835 nt2.3□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 YJL113WYJL113W 4647 nt2.3□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 HMT1YBR034C 1047 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 PHO2YDL106C 1680 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 NRP1YDL167C 2160 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 PAN2YGL094C 3348 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 YOL057WYOL057W 2136 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 GNT1YOR320C 1476 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 REC102YLR329W 795 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 FIG4YNL325C 2640 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 NOP14YDL148C 2433 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 TRA1YHR099W 11235 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 SDP1YIL113W 630 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 NNT1YLR285W 786 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-GR3Q12316 UBP3YER151C 2739 nt2.28□□□□□ -2.05
TY1B-GR3Q12316 CSH1YBR161W 1131 nt2.27□□□□□ -2.05
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