Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 KAP95YLR347C 2586 nt3.31□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 KRE2YDR483W 1329 nt3.31□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 RIM1YCR028C-A 408 nt3.31□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 HMO1YDR174W 741 nt3.31□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 RAV2YDR202C 1056 nt3.31□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.31□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 SLD5YDR489W 885 nt3.31□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 LOC1YFR001W 615 nt3.31□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 PGD1YGL025C 1194 nt3.31□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 CAP1YKL007W 807 nt3.31□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 PRM6YML047C 1059 nt3.31□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 YNL303WYNL303W 348 nt3.31□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 YBR053CYBR053C 1077 nt3.31□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 MUB1YMR100W 1863 nt3.3□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 HEF3YNL014W 3135 nt3.3□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 NUR1YDL089W 1455 nt3.3□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 STD1YOR047C 1335 nt3.3□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 YDR248CYDR248C 582 nt3.3□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 TAD1YGL243W 1203 nt3.3□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 YHL026CYHL026C 948 nt3.3□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 YJR020WYJR020W 333 nt3.3□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 AIM25YJR100C 984 nt3.3□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 YKL070WYKL070W 510 nt3.3□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 YKR011CYKR011C 1062 nt3.3□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 YPT52YKR014C 705 nt3.3□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 YKE2YLR200W 345 nt3.3□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 GIM5YML094W 492 nt3.3□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 ATP11YNL315C 957 nt3.3□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 PFY1YOR122C 381 nt3.3□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 ARL3YPL051W 597 nt3.3□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 FRE8YLR047C 2061 nt3.3□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 AGE1YDR524C 1449 nt3.29□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 RPS14AYCR031C 414 nt3.29□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 NSE4YDL105W 1209 nt3.29□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 MTC3YGL226W 372 nt3.29□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 YGR126WYGR126W 693 nt3.29□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 YHL044WYHL044W 708 nt3.29□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.29□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.29□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 RAD14YMR201C 1116 nt3.29□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 BRX1YOL077C 876 nt3.29□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 SHG1YBR258C 429 nt3.29□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 RSC1YGR056W 2787 nt3.29□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 MDV1YJL112W 2145 nt3.29□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 RAD5YLR032W 3510 nt3.29□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 FUS2YMR232W 2034 nt3.29□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 YER046W-AYER046W-A 330 nt3.28□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 AGE2YIL044C 897 nt3.28□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt3.28□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 ATG27YJL178C 816 nt3.28□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 ECM4YKR076W 1113 nt3.28□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 SRL4YPL033C 846 nt3.28□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 LRG1YDL240W 3054 nt3.28□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 PHO81YGR233C 3537 nt3.28□□□□□ -1.88
NMD4Q12129 ESC2YDR363W 1371 nt3.27□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 CWH41YGL027C 2502 nt3.27□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YDR061WYDR061W 1620 nt3.27□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 RTT109YLL002W 1311 nt3.27□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 MNT3YIL014W 1893 nt3.27□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YGR160WYGR160W 612 nt3.27□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 MRP8YKL142W 660 nt3.27□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YKT6YKL196C 603 nt3.27□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YNL089CYNL089C 477 nt3.27□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 TAZ1YPR140W 1146 nt3.27□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YLR108CYLR108C 1458 nt3.27□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.27□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 SSE2YBR169C 2082 nt3.26□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YDL242WYDL242W 354 nt3.26□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YDR042CYDR042C 603 nt3.26□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YGL039WYGL039W 1047 nt3.26□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 RPB9YGL070C 369 nt3.26□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 DSE2YHR143W 978 nt3.26□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt3.26□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 SDP1YIL113W 630 nt3.26□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YJR037WYJR037W 384 nt3.26□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 SHH3YMR118C 591 nt3.26□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 RCE1YMR274C 948 nt3.26□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 DYN3YMR299C 939 nt3.26□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 PDR17YNL264C 1053 nt3.26□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YBR063CYBR063C 1215 nt3.26□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YCL002CYCL002C 792 nt3.26□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 HFM1YGL251C 3564 nt3.26□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 MSH4YFL003C 2637 nt3.26□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 MTR4YJL050W 3222 nt3.26□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 ANR2YKL047W 1551 nt3.25□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 MIG3YER028C 1185 nt3.25□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YFL065CYFL065C 309 nt3.25□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 QCR10YHR001W-A 234 nt3.25□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YLL044WYLL044W 447 nt3.25□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YNL109WYNL109W 546 nt3.25□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 GRE2YOL151W 1029 nt3.25□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YJR030CYJR030C 2238 nt3.25□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 VPS3YDR495C 3036 nt3.25□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 NUP60YAR002W 1620 nt3.24□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 CPR5YDR304C 678 nt3.24□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 MVB12YGR206W 306 nt3.24□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YJL147CYJL147C 1149 nt3.24□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 SPP382YLR424W 2127 nt3.24□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 RFC3YNL290W 1023 nt3.24□□□□□ -1.89
NMD4Q12129 YOR152CYOR152C 771 nt3.24□□□□□ -1.89
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