Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	LSM4	YER112W	564 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	BRR6	YGL247W	594 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	RGI2	YIL057C	495 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	YAL034C-B	YAL034C-B	354 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	YKL156C-A	YKL156C-A	117 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	HYM1	YKL189W	1200 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	MRPL16	YBL038W	699 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	PFY1	YOR122C	381 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	YOR203W	YOR203W	354 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	YDR239C	YDR239C	2364 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	RGR1	YLR071C	3249 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	AXL1	YPR122W	3627 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	ISW1	YBR245C	3390 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	MEI4	YER044C-A	1227 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	SMA2	YML066C	1110 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	YML094C-A	YML094C-A	402 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	FMP41	YNL168C	780 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	APD1	YBR151W	951 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	YKR078W	YKR078W	1758 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	VIP1	YLR410W	3441 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	SOK1	YDR006C	2706 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	VPS9	YML097C	1356 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	MRPL32	YCR003W	552 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	ARF1	YDL192W	546 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	TCA17	YEL048C	459 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	COB	Q0105	1158 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	PEF1	YGR058W	1008 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	YLL037W	YLL037W	381 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	GTT2	YLL060C	702 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	YMR194C-A	YMR194C-A	225 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	MRPL33	YMR286W	261 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	POL30	YBR088C	777 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	PBP2	YBR233W	1242 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	snR44	snR44	211 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	YOR296W	YOR296W	3870 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	GWT1	YJL091C	1473 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	PPH3	YDR075W	927 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	MPS2	YGL075C	1164 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	SAM37	YMR060C	984 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	YMR087W	YMR087W	855 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	YNL184C	YNL184C	327 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	snR11	snR11	258 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	MMS1	YPR164W	4224 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	PAM1	YDR251W	2493 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	ART10	YLR392C	1557 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	MRD1	YPR112C	2664 nt		2.65	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	IKI3	YLR384C	4050 nt		2.65	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	YCK2	YNL154C	1641 nt		2.65	□□□□□ -1.98
VIK1	Q12045	YEL075C	YEL075C	369 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	YIP5	YGL161C	933 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	YGR039W	YGR039W	312 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	UPF3	YGR072W	1164 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	YGR073C	YGR073C	372 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	RPL24B	YGR148C	468 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	PSF2	YJL072C	642 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	NNT1	YLR285W	786 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	YOR062C	YOR062C	807 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	TPK2	YPL203W	1143 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	KEL2	YGR238C	2649 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	YIL082W-A	YIL082W-A	4497 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	DUN1	YDL101C	1542 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	YER079C-A	YER079C-A	339 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	AIM11	YER093C-A	414 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	YGR107W	YGR107W	450 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	AIM23	YJL131C	1071 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	PEX15	YOL044W	1152 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	GRX7	YBR014C	612 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	TOR1	YJR066W	7413 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	DSE1	YER124C	1722 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	MNT3	YIL014W	1893 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	YDR034C-C	YDR034C-C	1317 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	YLR410W-A	YLR410W-A	1317 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	BCK1	YJL095W	4437 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	SLY41	YOR307C	1362 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	HYP2	YEL034W	474 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	SMX2	YFL017W-A	234 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	MST27	YGL051W	705 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	YGL204C	YGL204C	306 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	CUP1-1	YHR053C	186 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	CUP1-2	YHR055C	186 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	DIA1	YMR316W	1011 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	SRL1	YOR247W	633 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	ACM1	YPL267W	630 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	YCG1	YDR325W	3108 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	MSB2	YGR014W	3921 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	SWR1	YDR334W	4545 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	SGM1	YJR134C	2124 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	TDA1	YMR291W	1761 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	YDL050C	YDL050C	372 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	PAU10	YDR542W	363 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	PAU11	YGL261C	363 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	YGR111W	YGR111W	1203 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	YHR182C-A	YHR182C-A	474 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	YKL131W	YKL131W	522 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	PAU4	YLR461W	363 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	TEM1	YML064C	738 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	BET5	YML077W	480 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	YBL062W	YBL062W	381 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	TYE7	YOR344C	876 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VIK1	Q12045	TOP2	YNL088W	4287 nt		2.62	□□□□□ -1.99

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