Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBRQ0VD83 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBRQ0VD83 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms