Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EP300Q09472 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EP300Q09472 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EP300Q09472 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EP300Q09472 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
EP300Q09472 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EP300Q09472 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EP300Q09472 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EP300Q09472 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EP300Q09472 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EP300Q09472 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EP300Q09472 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EP300Q09472 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EP300Q09472 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EP300Q09472 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EP300Q09472 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EP300Q09472 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
EP300Q09472 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
EP300Q09472 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
EP300Q09472 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
EP300Q09472 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
EP300Q09472 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
EP300Q09472 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
EP300Q09472 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EP300Q09472 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EP300Q09472 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EP300Q09472 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EP300Q09472 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
EP300Q09472 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
EP300Q09472 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EP300Q09472 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EP300Q09472 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EP300Q09472 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EP300Q09472 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EP300Q09472 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EP300Q09472 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EP300Q09472 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EP300Q09472 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EP300Q09472 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EP300Q09472 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EP300Q09472 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EP300Q09472 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EP300Q09472 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EP300Q09472 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EP300Q09472 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
EP300Q09472 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EP300Q09472 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EP300Q09472 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EP300Q09472 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EP300Q09472 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EP300Q09472 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EP300Q09472 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EP300Q09472 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EP300Q09472 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EP300Q09472 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EP300Q09472 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EP300Q09472 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EP300Q09472 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EP300Q09472 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EP300Q09472 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EP300Q09472 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EP300Q09472 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EP300Q09472 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EP300Q09472 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EP300Q09472 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EP300Q09472 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EP300Q09472 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EP300Q09472 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EP300Q09472 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
EP300Q09472 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EP300Q09472 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EP300Q09472 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EP300Q09472 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EP300Q09472 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EP300Q09472 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EP300Q09472 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EP300Q09472 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EP300Q09472 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EP300Q09472 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
EP300Q09472 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EP300Q09472 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
EP300Q09472 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
EP300Q09472 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EP300Q09472 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EP300Q09472 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EP300Q09472 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EP300Q09472 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EP300Q09472 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EP300Q09472 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EP300Q09472 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EP300Q09472 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EP300Q09472 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EP300Q09472 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EP300Q09472 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EP300Q09472 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EP300Q09472 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EP300Q09472 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EP300Q09472 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EP300Q09472 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EP300Q09472 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms