Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDR1Q08345 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
DDR1Q08345 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms