Protein–RNA interactions for Protein: Q07960

ARHGAP1, Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP1Q07960 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARHGAP1Q07960 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP1Q07960 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP1Q07960 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP1Q07960 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP1Q07960 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP1Q07960 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP1Q07960 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP1Q07960 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP1Q07960 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP1Q07960 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP1Q07960 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP1Q07960 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms