Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CXCL9Q07325 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCL9Q07325 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms