Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 YIL054WYIL054W 318 nt5.09□□□□□ -1.59
HDA3Q06623 YAL065CYAL065C 387 nt5.09□□□□□ -1.59
HDA3Q06623 BUD28YLR062C 378 nt5.09□□□□□ -1.59
HDA3Q06623 RPS16AYMR143W 432 nt5.09□□□□□ -1.59
HDA3Q06623 ATP3YBR039W 936 nt5.09□□□□□ -1.59
HDA3Q06623 ARC40YBR234C 1155 nt5.09□□□□□ -1.59
HDA3Q06623 FRM2YCL026C-A 582 nt5.09□□□□□ -1.59
HDA3Q06623 NDC80YIL144W 2076 nt5.09□□□□□ -1.59
HDA3Q06623 SKM1YOL113W 1968 nt5.09□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 YJR015WYJR015W 1533 nt5.08□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 RPS14AYCR031C 414 nt5.08□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 snR68snR68 136 nt5.08□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 YGR107WYGR107W 450 nt5.08□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 YJL086CYJL086C 369 nt5.08□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 APS1YLR170C 471 nt5.08□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 PKR1YMR123W 369 nt5.08□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 ICY1YMR195W 384 nt5.08□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 NTH2YBR001C 2343 nt5.08□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 PRR1YKL116C 1557 nt5.08□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 MCM2YBL023C 2607 nt5.07□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 IRC2YDR112W 309 nt5.07□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 LPP1YDR503C 825 nt5.07□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 GRX4YER174C 735 nt5.07□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt5.07□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt5.07□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 PCL5YHR071W 690 nt5.07□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 RPS24BYIL069C 408 nt5.07□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 YKE2YLR200W 345 nt5.07□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt5.07□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 YPT53YNL093W 663 nt5.07□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 snR10snR10 245 nt5.07□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 FRE3YOR381W 2136 nt5.07□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 STV1YMR054W 2673 nt5.07□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 YND1YER005W 1893 nt5.07□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 RMR1YGL250W 726 nt5.06□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 VTI1YMR197C 654 nt5.06□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 CDC33YOL139C 642 nt5.06□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 SED4YCR067C 3198 nt5.06□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 ARN2YHL047C 1863 nt5.06□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 IKS1YJL057C 2004 nt5.06□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 APL6YGR261C 2430 nt5.05□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 YDL009CYDL009C 324 nt5.05□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 PRO3YER023W 861 nt5.05□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 YER107W-AYER107W-A 321 nt5.05□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 LAG1YHL003C 1236 nt5.05□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 SSO1YPL232W 873 nt5.05□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt5.05□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 YBR242WYBR242W 717 nt5.05□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 DNF2YDR093W 4839 nt5.05□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 POL4YCR014C 1749 nt5.05□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 UBA2YDR390C 1911 nt5.05□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 YJR085CYJR085C 318 nt5.04□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 GPI17YDR434W 1605 nt5.04□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 MMP1YLL061W 1752 nt5.04□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 KAR9YPL269W 1935 nt5.03□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 PPZ1YML016C 2079 nt5.03□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 SYO1YDL063C 1863 nt5.03□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 SWP82YFL049W 1872 nt5.03□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 COX4YGL187C 468 nt5.03□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 RMP1YLR145W 606 nt5.03□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 ERP4YOR016C 624 nt5.03□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 YPL276WYPL276W 438 nt5.03□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 IMA1YGR287C 1770 nt5.03□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 VPS45YGL095C 1734 nt5.03□□□□□ -1.6
HDA3Q06623 ELP2YGR200C 2367 nt5.02□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 MCH4YOL119C 1506 nt5.02□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 HDA2YDR295C 2025 nt5.02□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 SRD1YCR018C 666 nt5.02□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 YDR090CYDR090C 933 nt5.02□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 YER084WYER084W 387 nt5.02□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 SMX2YFL017W-A 234 nt5.02□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt5.02□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 NIT2YJL126W 924 nt5.02□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 RPL39YJL189W 156 nt5.02□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 YAL037WYAL037W 804 nt5.02□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt5.02□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 MDG1YNL173C 1101 nt5.02□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 YOR318CYOR318C 306 nt5.02□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt5.02□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 YAP1YML007W 1953 nt5.02□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 MBP1YDL056W 2502 nt5.01□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 THI7YLR237W 1797 nt5.01□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 STP2YHR006W 1626 nt5.01□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 HXT14YNL318C 1623 nt5.01□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 BLM10YFL007W 6432 nt5.01□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 RPP1AYDL081C 321 nt5.01□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt5.01□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 BLI1YKL061W 342 nt5.01□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 PAM18YLR008C 507 nt5.01□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 FUI1YBL042C 1920 nt5.01□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 MGS1YNL218W 1764 nt5.01□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 GSM1YJL103C 1857 nt5□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 VAC8YEL013W 1737 nt5□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 PDI1YCL043C 1569 nt5□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 AAD4YDL243C 990 nt5□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 YFL032WYFL032W 321 nt5□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 ECO1YFR027W 846 nt5□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 TCD1YHR003C 1290 nt5□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 YLR076CYLR076C 423 nt5□□□□□ -1.61
HDA3Q06623 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21 ms