Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
ATP7AQ04656 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms