Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBE1Q04446 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms