Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms