Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms