Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
OTUD4Q01804 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms