Protein–RNA interactions for Protein: Q01543

FLI1, Friend leukemia integration 1 transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLI1Q01543 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FLI1Q01543 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FLI1Q01543 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms