Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CLTCQ00610 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms