Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms