Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX1P83916 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX1P83916 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX1P83916 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX1P83916 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX1P83916 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX1P83916 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX1P83916 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX1P83916 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX1P83916 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX1P83916 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX1P83916 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CBX1P83916 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX1P83916 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX1P83916 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX1P83916 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX1P83916 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX1P83916 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX1P83916 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX1P83916 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX1P83916 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX1P83916 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX1P83916 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX1P83916 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX1P83916 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CBX1P83916 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX1P83916 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX1P83916 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX1P83916 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX1P83916 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CBX1P83916 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CBX1P83916 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX1P83916 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CBX1P83916 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CBX1P83916 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX1P83916 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX1P83916 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CBX1P83916 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CBX1P83916 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX1P83916 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX1P83916 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX1P83916 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX1P83916 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX1P83916 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX1P83916 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX1P83916 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX1P83916 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX1P83916 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX1P83916 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX1P83916 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX1P83916 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX1P83916 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX1P83916 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX1P83916 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX1P83916 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX1P83916 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX1P83916 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX1P83916 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX1P83916 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX1P83916 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX1P83916 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX1P83916 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX1P83916 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX1P83916 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX1P83916 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX1P83916 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX1P83916 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX1P83916 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX1P83916 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX1P83916 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX1P83916 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX1P83916 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX1P83916 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX1P83916 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX1P83916 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX1P83916 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms