Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELF3P78545 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELF3P78545 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELF3P78545 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELF3P78545 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELF3P78545 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELF3P78545 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELF3P78545 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ELF3P78545 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ELF3P78545 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ELF3P78545 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ELF3P78545 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ELF3P78545 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ELF3P78545 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELF3P78545 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELF3P78545 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELF3P78545 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELF3P78545 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELF3P78545 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELF3P78545 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELF3P78545 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELF3P78545 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELF3P78545 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELF3P78545 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELF3P78545 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELF3P78545 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELF3P78545 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELF3P78545 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELF3P78545 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELF3P78545 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELF3P78545 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELF3P78545 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELF3P78545 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELF3P78545 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELF3P78545 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELF3P78545 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELF3P78545 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELF3P78545 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELF3P78545 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELF3P78545 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELF3P78545 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELF3P78545 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELF3P78545 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELF3P78545 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELF3P78545 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELF3P78545 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELF3P78545 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ELF3P78545 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELF3P78545 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELF3P78545 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELF3P78545 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELF3P78545 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ELF3P78545 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELF3P78545 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELF3P78545 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELF3P78545 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELF3P78545 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELF3P78545 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELF3P78545 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELF3P78545 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELF3P78545 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ELF3P78545 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELF3P78545 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELF3P78545 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELF3P78545 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELF3P78545 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELF3P78545 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELF3P78545 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELF3P78545 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELF3P78545 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELF3P78545 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELF3P78545 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELF3P78545 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELF3P78545 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ELF3P78545 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELF3P78545 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELF3P78545 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELF3P78545 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELF3P78545 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELF3P78545 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELF3P78545 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELF3P78545 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELF3P78545 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELF3P78545 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELF3P78545 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELF3P78545 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELF3P78545 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELF3P78545 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELF3P78545 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELF3P78545 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELF3P78545 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELF3P78545 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELF3P78545 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELF3P78545 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELF3P78545 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELF3P78545 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELF3P78545 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELF3P78545 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELF3P78545 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELF3P78545 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms