Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms