Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFC1-1P60608 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms