Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms