Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BACE1P56817 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BACE1P56817 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BACE1P56817 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BACE1P56817 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BACE1P56817 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BACE1P56817 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BACE1P56817 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE1P56817 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE1P56817 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE1P56817 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE1P56817 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE1P56817 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE1P56817 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE1P56817 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE1P56817 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE1P56817 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE1P56817 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE1P56817 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE1P56817 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE1P56817 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE1P56817 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE1P56817 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE1P56817 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE1P56817 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE1P56817 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BACE1P56817 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BACE1P56817 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BACE1P56817 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BACE1P56817 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BACE1P56817 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BACE1P56817 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BACE1P56817 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BACE1P56817 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BACE1P56817 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BACE1P56817 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BACE1P56817 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BACE1P56817 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BACE1P56817 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BACE1P56817 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BACE1P56817 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE1P56817 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE1P56817 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE1P56817 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE1P56817 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE1P56817 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE1P56817 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE1P56817 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE1P56817 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE1P56817 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE1P56817 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE1P56817 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BACE1P56817 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BACE1P56817 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BACE1P56817 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BACE1P56817 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BACE1P56817 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BACE1P56817 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BACE1P56817 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BACE1P56817 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BACE1P56817 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BACE1P56817 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BACE1P56817 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BACE1P56817 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BACE1P56817 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BACE1P56817 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BACE1P56817 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BACE1P56817 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BACE1P56817 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BACE1P56817 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BACE1P56817 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BACE1P56817 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BACE1P56817 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BACE1P56817 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BACE1P56817 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BACE1P56817 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BACE1P56817 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BACE1P56817 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BACE1P56817 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BACE1P56817 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BACE1P56817 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BACE1P56817 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BACE1P56817 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BACE1P56817 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BACE1P56817 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BACE1P56817 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BACE1P56817 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BACE1P56817 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BACE1P56817 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BACE1P56817 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BACE1P56817 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BACE1P56817 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BACE1P56817 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BACE1P56817 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BACE1P56817 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BACE1P56817 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BACE1P56817 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BACE1P56817 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BACE1P56817 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BACE1P56817 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms