Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMTNP53814 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMTNP53814 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMTNP53814 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMTNP53814 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMTNP53814 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMTNP53814 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMTNP53814 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMTNP53814 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMTNP53814 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMTNP53814 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMTNP53814 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMTNP53814 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMTNP53814 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMTNP53814 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMTNP53814 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMTNP53814 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMTNP53814 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMTNP53814 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMTNP53814 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMTNP53814 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMTNP53814 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMTNP53814 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMTNP53814 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMTNP53814 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMTNP53814 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMTNP53814 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMTNP53814 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMTNP53814 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMTNP53814 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMTNP53814 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMTNP53814 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMTNP53814 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMTNP53814 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMTNP53814 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMTNP53814 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMTNP53814 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMTNP53814 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMTNP53814 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMTNP53814 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMTNP53814 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMTNP53814 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMTNP53814 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMTNP53814 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMTNP53814 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMTNP53814 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMTNP53814 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMTNP53814 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMTNP53814 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMTNP53814 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMTNP53814 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMTNP53814 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMTNP53814 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMTNP53814 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMTNP53814 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNP53814 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNP53814 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNP53814 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNP53814 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNP53814 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNP53814 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNP53814 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNP53814 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNP53814 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNP53814 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNP53814 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNP53814 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNP53814 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNP53814 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNP53814 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNP53814 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNP53814 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNP53814 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNP53814 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNP53814 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNP53814 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNP53814 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNP53814 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNP53814 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNP53814 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNP53814 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNP53814 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNP53814 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNP53814 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNP53814 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNP53814 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNP53814 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNP53814 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNP53814 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNP53814 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNP53814 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNP53814 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNP53814 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNP53814 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNP53814 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNP53814 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNP53814 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNP53814 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNP53814 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNP53814 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms