Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERFP50548 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERFP50548 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERFP50548 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERFP50548 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERFP50548 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERFP50548 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERFP50548 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERFP50548 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERFP50548 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERFP50548 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERFP50548 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERFP50548 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERFP50548 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERFP50548 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERFP50548 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERFP50548 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERFP50548 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERFP50548 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERFP50548 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERFP50548 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERFP50548 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERFP50548 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERFP50548 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERFP50548 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERFP50548 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERFP50548 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERFP50548 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ERFP50548 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERFP50548 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERFP50548 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ERFP50548 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERFP50548 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERFP50548 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERFP50548 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERFP50548 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERFP50548 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERFP50548 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERFP50548 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERFP50548 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERFP50548 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERFP50548 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERFP50548 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERFP50548 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERFP50548 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERFP50548 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERFP50548 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERFP50548 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERFP50548 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERFP50548 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERFP50548 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERFP50548 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERFP50548 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERFP50548 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERFP50548 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERFP50548 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERFP50548 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERFP50548 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERFP50548 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERFP50548 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERFP50548 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERFP50548 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERFP50548 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERFP50548 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERFP50548 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERFP50548 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERFP50548 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERFP50548 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERFP50548 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERFP50548 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERFP50548 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERFP50548 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERFP50548 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERFP50548 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERFP50548 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERFP50548 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERFP50548 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERFP50548 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERFP50548 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERFP50548 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERFP50548 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERFP50548 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERFP50548 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERFP50548 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERFP50548 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERFP50548 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERFP50548 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERFP50548 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERFP50548 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERFP50548 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERFP50548 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERFP50548 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERFP50548 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERFP50548 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERFP50548 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERFP50548 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERFP50548 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERFP50548 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERFP50548 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERFP50548 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms