Protein–RNA interactions for Protein: P49914

MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSP49914 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MTHFSP49914 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms