Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms