Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
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TTPAP49638 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTPAP49638 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTPAP49638 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTPAP49638 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTPAP49638 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTPAP49638 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTPAP49638 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTPAP49638 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTPAP49638 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTPAP49638 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTPAP49638 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTPAP49638 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTPAP49638 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTPAP49638 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTPAP49638 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTPAP49638 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTPAP49638 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTPAP49638 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTPAP49638 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTPAP49638 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTPAP49638 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTPAP49638 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTPAP49638 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TTPAP49638 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTPAP49638 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTPAP49638 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTPAP49638 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTPAP49638 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTPAP49638 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTPAP49638 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTPAP49638 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTPAP49638 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTPAP49638 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTPAP49638 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTPAP49638 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTPAP49638 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTPAP49638 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTPAP49638 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTPAP49638 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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TTPAP49638 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTPAP49638 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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TTPAP49638 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTPAP49638 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTPAP49638 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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TTPAP49638 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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TTPAP49638 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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TTPAP49638 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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TTPAP49638 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTPAP49638 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTPAP49638 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTPAP49638 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTPAP49638 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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TTPAP49638 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
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TTPAP49638 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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TTPAP49638 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TTPAP49638 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TTPAP49638 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TTPAP49638 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TTPAP49638 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TTPAP49638 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TTPAP49638 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTPAP49638 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTPAP49638 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTPAP49638 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTPAP49638 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTPAP49638 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTPAP49638 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTPAP49638 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTPAP49638 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TTPAP49638 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTPAP49638 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTPAP49638 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TTPAP49638 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTPAP49638 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTPAP49638 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTPAP49638 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTPAP49638 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTPAP49638 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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