Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms