Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms