Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms