Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms