Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR1P43307 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR1P43307 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR1P43307 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR1P43307 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR1P43307 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR1P43307 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR1P43307 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR1P43307 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR1P43307 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSR1P43307 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSR1P43307 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSR1P43307 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSR1P43307 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSR1P43307 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSR1P43307 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSR1P43307 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSR1P43307 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSR1P43307 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSR1P43307 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSR1P43307 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSR1P43307 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSR1P43307 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR1P43307 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR1P43307 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR1P43307 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR1P43307 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR1P43307 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR1P43307 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR1P43307 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR1P43307 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR1P43307 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR1P43307 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR1P43307 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR1P43307 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR1P43307 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR1P43307 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR1P43307 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR1P43307 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR1P43307 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR1P43307 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR1P43307 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR1P43307 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR1P43307 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR1P43307 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR1P43307 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR1P43307 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR1P43307 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR1P43307 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR1P43307 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR1P43307 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR1P43307 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR1P43307 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR1P43307 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR1P43307 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR1P43307 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR1P43307 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR1P43307 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR1P43307 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSR1P43307 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSR1P43307 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSR1P43307 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSR1P43307 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSR1P43307 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSR1P43307 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSR1P43307 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSR1P43307 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSR1P43307 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSR1P43307 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSR1P43307 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSR1P43307 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR1P43307 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR1P43307 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR1P43307 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR1P43307 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR1P43307 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR1P43307 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR1P43307 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR1P43307 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR1P43307 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR1P43307 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR1P43307 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR1P43307 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR1P43307 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR1P43307 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR1P43307 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR1P43307 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR1P43307 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR1P43307 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR1P43307 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR1P43307 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR1P43307 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR1P43307 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR1P43307 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR1P43307 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR1P43307 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR1P43307 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR1P43307 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR1P43307 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR1P43307 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms