Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CAP42336 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms